Aber eben kein Familienzusammenführungsvisum...oder übersehe ich das?
Es gibt in Österreich nichts, was Familienzusammenführungsvisum heißt. Es heißt "Aufenthaltstitel Familienangehöriger", auf englisch "residence permit family member". Das ist auch bei der Kommunikation mit Behörden zu beachten, die bei falschen Begriffen oft nicht entsprechend reagieren, statt dessen kann das zu größeren Missverständnissen führen.
Soweit ich das verstehe, muss der Antrag auf den Aufenthaltstitel bei der österreichischen Botschaft Manila eingereicht werden. Wenn der Aufenthaltstitel bewilligt ist, muss er persönlich in Österreich abgeholt werden. Dazu braucht die Person ein kurzfristiges Visum, um überhaupt nach Österreich einreisen zu können. Dieses Visum "National Visa for Approved Residence Permit" ist vermutlich bei VFS zu beantragen.
Ich würde die österreichische Botschaft anrufen und fragen, ob diese Vorgangsweise korrekt ist bzw. wo man den Aufenthaltstitel beantragen soll.